Serialul spune povestea a doi frati care, in plictiseala vacantei de vara, se gandesc sa faca diferite lucruri iesite din comun pentru a avea ce povesti prietenilor. Astfel, ajung sa sfideze legile gravitatiei, sa ajunga pe luna si sa construiasca diferite lucruri iesite din comun. Pe de alta parte, sora lor, Candace, vrei sa-i parasca mamei pe cei doi; dar nu vor fi prinsi niciodata.
Serialul ne mai spune povestea unui doctor malefic, care pune la cale fel de fel de planuri nebunesti – ce nu-i vor reusi, pentru ca va fi oprit la timp de Agentul P, ornitorincul lui Phineas si Ferb, care lucreaza sub acoperire.
